WEKO3
アイテム
マイクロサテライト分析に基づく日本のエミュー飼養集団における遺伝的多様度
https://nodai.repo.nii.ac.jp/records/788
https://nodai.repo.nii.ac.jp/records/7888a9ec7f0-6d8b-43db-82fc-c7045884ad83
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
---|---|---|
64_42 (1.2 MB)
|
Item type | [ELS]紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||
---|---|---|---|---|---|---|
公開日 | 2019-10-11 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | マイクロサテライト分析に基づく日本のエミュー飼養集団における遺伝的多様度 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | Genetic Diversity of Emu Population in a Japanese Farm Based on Microsatellite DNA Analysis | |||||
言語 | en | |||||
言語 | ||||||
言語 | eng | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | エミュー | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | 遺伝的多様度 | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | 遺伝的構造 | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | マイクロサテライトマーカー | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | emu | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | genetic diversity | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | genetic structure | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | microsatellite markers | |||||
資源タイプ | ||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||
雑誌書誌ID | ||||||
収録物識別子タイプ | NCID | |||||
収録物識別子 | AN00164184 | |||||
ページ属性 | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | P | |||||
論文名よみ | ||||||
タイトル | マイクロサテライト ブンセキ ニ モトヅク ニホン ノ エミュー シヨウ シュウダン ニ オケル イデンテキ タヨウド | |||||
著者 |
輿石, 雄一
× 輿石, 雄一× 大久保, 倫子× 下井, 岳× 平山, 博樹× 相馬, 幸作× 和田, 健太× Koshiishi, Yuichi× Murata-Okubo, Michiko× Shimoi, Gaku× Hirayama, Hiroki× Souma, Kousaku× Wada, Kenta |
|||||
著者所属(日) | ||||||
値 | 東京農業大学大学院生物産業学研究科生物産業学専攻 | |||||
著者所属(日) | ||||||
値 | 東京農業大学生物産業学部北方圏農学科 | |||||
著者所属(日) | ||||||
値 | 東京農業大学大学院生物産業学研究科生物産業学専攻 | |||||
著者所属(日) | ||||||
値 | 東京農業大学生物産業学部北方圏農学科 | |||||
著者所属(日) | ||||||
値 | 東京農業大学生物産業学部北方圏農学科 | |||||
著者所属(日) | ||||||
値 | 東京農業大学大学院生物産業学研究科生物産業学専攻 | |||||
著者所属(英) | ||||||
言語 | en | |||||
値 | Laboratory of Animal Resources and Development | |||||
著者所属(英) | ||||||
言語 | en | |||||
値 | Laboratory of Livestock Production and Management, Graduate School of Bioindustry, Tokyo University of Agriculture | |||||
著者所属(英) | ||||||
言語 | en | |||||
値 | Laboratory of Animal Resources and Development | |||||
著者所属(英) | ||||||
言語 | en | |||||
値 | Laboratory of Livestock Production and Management, Graduate School of Bioindustry, Tokyo University of Agriculture | |||||
著者所属(英) | ||||||
言語 | en | |||||
値 | Laboratory of Livestock Production and Management, Graduate School of Bioindustry, Tokyo University of Agriculture | |||||
著者所属(英) | ||||||
言語 | en | |||||
値 | Laboratory of Animal Resources and Development | |||||
記事種別(日) | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | 論文 | |||||
記事種別(英) | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | Article | |||||
抄録(日) | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | エミュー(Dromaius novaehollandiae)は食肉,卵およびオイルを生産する新規動物資源となることが期待されている。しかしながら,エミュー産業の歴史は浅く,その生産形質の遺伝的改良はほとんど進んでいない。我々は,日本で最大規模となる北海道網走市のエミュー牧場の個体群を対象としてマイクロサテライト解析に基づく遺伝的多様度を経年的に調査した。検出されたアレルの数(NA)は2013,2014,2015および2016年でそれぞれ4.83,4.17,4.17および7.17であり,ヘテロ接合率(HE/HO)はそれぞれ0.466/0.339,0.426/0.325,0.433/0.384および0.550/0.347であった。近交係数(FIS)は調査したすべての世代において正の値を示し,2016年に孵化した個体では0.369と最も高い値が観察された。Structureプログラムを用いた解析では,本集団は3つのクラスターに分かれ,2016年に孵化した個体群は明らかに他の世代とは異なる遺伝的構成を示した。またアレル共有率に基づく系統樹は5つのクレードを示し,2016年に孵化した個体の約半数は一つのクレードに属した。本研究は,網走市のエミュー集団は遺伝的多様度が低いこと,遺伝的に3-5の異なる系統から構成されること,ならびに2016年に孵化した個体の遺伝的構成が他の世代とは異なることを確認した。 | |||||
抄録(英) | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | The emu (Dromaius novaehollandiae) is predicted to be a new livestock animal for oil, meat and egg production. However, the genetic structure of emu populations in Japanese farms is scarcely known. The aim of this study was to determine the genetic diversity and population structure in the largest emu farm in Japan. We collected feather pulps of emu chicks (N=131) from 40, 20, 23, and 48 individuals hatched at 2013, 2014, 2015, and 2016, respectively, in the Okhotsk Emu farm in Abashiri, Hokkaido, Japan. Using six microsatellite markers, we investigated the genetic diversity and structure of this farmed emu population. The number of alleles (NA) were 4.83, 4.17, 4.17, and 7.17, in individuals hatched in 2013, 2014, 2015, and 2016, respectively. Expected and observed heterozygosity (HE ; HO, respectively) was 0.466/0.339, 0.426/0.325, 0.433/0.384, and 0.550/0.347, in each year, respectively. A high inbreeding coefficient (FIS) was observed in all tested generations (0.113-0.369). The Structure program and unrooted phylogenetic tree analysis showed that the Abashiri emu population is largely divided into three to five different clades. Our results suggested that the genetic diversity in the Abashiri emu population is low, and that it contains three to five genetic lineages. These data may help guide a more sustainable breeding of emus in Japan. | |||||
書誌情報 | 巻 64, 号 2, p. 42-48, 発行日 2019-09-24 | |||||
表示順 | ||||||
内容記述タイプ | Other | |||||
内容記述 | 2 |